Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Setd4P58467 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Setd4P58467 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms