Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf16P58334 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf16P58334 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms