Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcbp4P57724 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcbp4P57724 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms