Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NcstnP57716 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms