Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bace1P56818 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace1P56818 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bace1P56818 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bace1P56818 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms