Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc1a3P56564 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms