Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Atp5eP56382 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Atp5eP56382 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms