Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pex2P55098 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pex2P55098 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pex2P55098 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms