Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ephb3P54754 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms