Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf9P54130 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf9P54130 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms