Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PctpP53808 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PctpP53808 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PctpP53808 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PctpP53808 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PctpP53808 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PctpP53808 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PctpP53808 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PctpP53808 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PctpP53808 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PctpP53808 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms