Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PklrP53657 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PklrP53657 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PklrP53657 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PklrP53657 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PklrP53657 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PklrP53657 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PklrP53657 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PklrP53657 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PklrP53657 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PklrP53657 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PklrP53657 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PklrP53657 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PklrP53657 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PklrP53657 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PklrP53657 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PklrP53657 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PklrP53657 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PklrP53657 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PklrP53657 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PklrP53657 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms