Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RabggtbP53612 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RabggtbP53612 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms