Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cux1P53564 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cux1P53564 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cux1P53564 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cux1P53564 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms