Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1cP52432 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr1cP52432 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms