Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ClgnP52194 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ClgnP52194 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms