Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ApodP51910 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApodP51910 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ApodP51910 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApodP51910 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApodP51910 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApodP51910 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApodP51910 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApodP51910 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms