Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CntfP51642 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CntfP51642 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CntfP51642 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CntfP51642 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CntfP51642 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CntfP51642 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CntfP51642 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CntfP51642 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CntfP51642 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CntfP51642 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CntfP51642 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfP51642 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CntfP51642 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms