Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1swP51491 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms