Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod1P49813 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Tmod1P49813 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Tmod1P49813 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmod1P49813 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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