Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtpreP49446 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtpreP49446 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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