Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rbp3P49194 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbp3P49194 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms