Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CitP49025 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CitP49025 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CitP49025 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CitP49025 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CitP49025 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CitP49025 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms