Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Abcd1P48410 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcd1P48410 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms