Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrprbP47758 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrprbP47758 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrprbP47758 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrprbP47758 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms