Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11bP46638 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms