Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf1P46099 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms