Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkx2-2P42586 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms