Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ThpoP40226 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ThpoP40226 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ThpoP40226 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ThpoP40226 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms