Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chd1P40201 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd1P40201 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd1P40201 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms