Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf1P39428 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf1P39428 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf1P39428 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf1P39428 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms