Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lig1P37913 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms