Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KdrP35918 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KdrP35918 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KdrP35918 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdrP35918 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdrP35918 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdrP35918 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdrP35918 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KdrP35918 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KdrP35918 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KdrP35918 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdrP35918 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdrP35918 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdrP35918 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdrP35918 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdrP35918 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KdrP35918 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KdrP35918 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KdrP35918 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KdrP35918 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KdrP35918 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KdrP35918 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KdrP35918 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KdrP35918 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms