Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab20P35295 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms