Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab6aP35279 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab6aP35279 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab6aP35279 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab6aP35279 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab6aP35279 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab6aP35279 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab6aP35279 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms