Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc5P32043 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc5P32043 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms