Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms