Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vcam1P29533 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vcam1P29533 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms