Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pabpc1P29341 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pabpc1P29341 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms