Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GrnP28798 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GrnP28798 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GrnP28798 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GrnP28798 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GrnP28798 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GrnP28798 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GrnP28798 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GrnP28798 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GrnP28798 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GrnP28798 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GrnP28798 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GrnP28798 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GrnP28798 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GrnP28798 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GrnP28798 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GrnP28798 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GrnP28798 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms