Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RxraP28700 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RxraP28700 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RxraP28700 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RxraP28700 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RxraP28700 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RxraP28700 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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