Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BgnP28653 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BgnP28653 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BgnP28653 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BgnP28653 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BgnP28653 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BgnP28653 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BgnP28653 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BgnP28653 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BgnP28653 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BgnP28653 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BgnP28653 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BgnP28653 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BgnP28653 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BgnP28653 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BgnP28653 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BgnP28653 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BgnP28653 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BgnP28653 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BgnP28653 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BgnP28653 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BgnP28653 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms