Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2-DMaP28078 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2-DMaP28078 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2-DMaP28078 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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