Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CenpbP27790 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CenpbP27790 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms