Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2afxP27661 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2afxP27661 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms