Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd40lgP27548 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd40lgP27548 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms