Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfraP26618 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfraP26618 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms