Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChgaP26339 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ChgaP26339 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms