Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gabra3P26049 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabra3P26049 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms