Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk11bP24788 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk11bP24788 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms